MDGRAPE-3

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MDGRAPE-3 ist ein Ultrahochleistungssupercomputer, der vom Forschungsinstitut RIKEN in Japan hergestellt wurde. Das System wurde speziell für Moleküldynamik-Simulationen entworfen, genauer für die Berechnung von Proteinstrukturen.

MDGRAPE-3 besteht aus 201 Einheiten mit jeweils 24 MDGRAPE-3-Chips (insgesamt 4824) und zusätzlichen Dual-Core-Intel-Xeon-Prozessoren (Codename „Dempsey“), die als Host-Maschinen dienen.

Im Juni 2006 verkündete RIKEN die Fertigstellung des Systems, das eine Billiarde Gleitkommaoperationen pro Sekunde (1 Peta Flop/s) durchführen kann. Das ist etwa doppelt so schnell als BlueGene/L von IBM, das die TOP500-Liste der schnellsten Supercomputer vom November 2007 anführt. Da MDGRAPE-3 kein System für allgemeine Berechnungen ist, sondern spezielle Aufgaben bearbeitet, konnte er sich wegen der Inkompablität zu Linpack nicht für die TOP500 Liste qualifizieren. Deshalb wird das System oft als ein Beispiel für die negativen Aspekte Linpacks genannt.

[Bearbeiten] Weblinks

• MD-GRAPE Project@IBM
• High-Performance Molecular Simulation Team@RIKEN
• Peta Computing Institute
• Tetsu Narumi's MDGRAPE page
• Molecular Dynamics Machine using MDGRAPE-2